医院肛肠科创建于1958年，是集医疗、教学、科研、预防保健于一体的大连市一级重点学科，2017年获批辽宁省重点专科建设项目。是辽东半岛肛肠病预防治疗和研究中心，大连市肛肠病防治中心和大连市肛肠病研究所。 科室拥有一支老、中、青结合，梯队合理，训练有素，学术优势互补，服务一流的人才队伍。肛肠科全体医护人员将始终秉承“以病人为中心”的服务宗旨，为广大就医患者提供优质满意的医疗服务。

肛肠科下设十一个科室。肛肠一、二、三科室主要侧重于结直肠肿瘤诊断与治疗，其余肛四至肛十病房侧重于肛周疾病的诊断治疗，另设肛肠科VIP病房，为患者提供更加人性化的医疗和护理服务。科室按现代化三级甲等医院建设标准设置单人高档病房、双人高档病房、三人中档病房和普通病房，年均门诊量2.6万人次，收住院患者4000余人次，肛肠病手术5000余例；其中，结直肠肿瘤手术500余例。

肛肠科拥有腹腔镜、肛门内镜微创系统、电子结肠镜、肛门直肠压力测定仪、肛肠多功能检查治疗仪、生物反馈刺激仪、肛肠压力检测仪以及超声波理疗仪等多种肛周疾病相关诊疗设备。科室连续多年承担国家级和省部级等科研项目，获多项科技成果及专利，科研成果直接应用于临床，大大提高了科室的整体诊疗水平。